توفر خزانات التخمير المصنوعة من الستانلس ستيل بيئة خاضعة للتحكم تتيح نمو الكائنات الدقيقة أو الخلايا وتحفيز الإنزيمات للتفاعلات الكيميائية الحيوية. وتختلف تكوينات الخزانات حسب طبيعة العملية، سواء كانت تخميرًا في الحالة الصلبة أو السائلة، أو تشغيلًا هوائيًا أو لاهوائيًا، أو تقليبًا ميكانيكيًا أو باستخدام الرفع الهوائي، أو تنمية المزارع في مرحلة واحدة أو عدة مراحل قبل التخمير الإنتاجي.

يدخل وسط الزراعة إلى الخزان أولًا، ويحافظ جهاز التقليب على حركته طوال عملية التخمير. ومع دوران السائل، تتوزع المغذيات والحرارة بصورة أكثر تجانسًا داخل المزرعة. وتتلقى عمليات التخمير الهوائي، التي تتطلب الأكسجين لنمو الكائنات الدقيقة، هواءً مضغوطًا معقمًا بالترشيح عبر موزع هواء في قاع الخزان، بينما يعمل جهاز التقليب على تشتيت الهواء في صورة فقاعات لتحسين انتقال الأكسجين. ويراقب نظام التحكم درجة الحرارة والضغط ودرجة الحموضة (pH) ومستوى السائل طوال العملية، ويضبط سرعة جهاز التقليب أو معدل تدفق الهواء عند الحاجة. وبعد اكتمال دورة التخمير، يُفرَّغ المنتج المخمّر من الخزان عبر مسار تفريغ معقم.